(Co ma karta dźwiękowa do ładowania się wtyczek?

)
Za mało szczegółów podałeś. Tylko jasnowidz mógłby napisać, że to i to jest problemem i tak by było w rzeczywistości.
Może brak działania powoduje konfliktowy sterownik MIDI a nie wtyczki? Może niektóre wtyczki - choć oryginalne - są po prostu "badziewiaste" i Cubase ich nie lubi? (Choć to mało prawdopodobne bo jednym z bardziej wymagających pod względem wtyczek jest Wavelab - a ten, jak mówisz, chodzi bez problemu)A może system nie przeinstalowywany od dwóch lat powoduje te problemy...
Na Twoim miejscu przeprowadziłbym małe śledztwo. Cubase, podczas uruchamiania (nie wiem jak starsze wersje ale SX na pewno) wypisuje na ekranie startowym, jakie moduły i wtyczki uruchamia. Dobrze się temu przyjrzyj.
Damian